Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Gm21818J3KMS6 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Gm21818J3KMS6 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms