Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrit3W8DXL4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit3W8DXL4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms