Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer3W4VSP1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms