Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26992S4R1A3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms