Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac5Q9Z2V6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms