Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms