Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt16Q9Z2K1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt16Q9Z2K1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms