Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne2Q9Z238 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms