Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip6Q9Z1Y4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip6Q9Z1Y4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms