Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stk39Q9Z1W9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk39Q9Z1W9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms