Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms