Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf1Q9Z1B8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf1Q9Z1B8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms