Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setbp1Q9Z180 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setbp1Q9Z180 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setbp1Q9Z180 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms