Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pmfbp1Q9WVQ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms