Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx1Q9WV80 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms