Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArcQ9WV31 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArcQ9WV31 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArcQ9WV31 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArcQ9WV31 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArcQ9WV31 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArcQ9WV31 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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ArcQ9WV31 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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ArcQ9WV31 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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ArcQ9WV31 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ArcQ9WV31 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArcQ9WV31 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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