Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnip1Q9WUU8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnip1Q9WUU8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnip1Q9WUU8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms