Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn5Q9WU28 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn5Q9WU28 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms