Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms