Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PplQ9R269 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PplQ9R269 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PplQ9R269 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PplQ9R269 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PplQ9R269 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms