Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc5Q9R1X5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc5Q9R1X5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms