Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sept6Q9R1T4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept6Q9R1T4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms