Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S0

B9d1, B9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B9d1Q9R1S0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B9d1Q9R1S0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B9d1Q9R1S0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms