Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf7Q9R1C0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms