Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit2Q9R1B9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slit2Q9R1B9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slit2Q9R1B9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms