Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htra1Q9R118 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra1Q9R118 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms