Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrpxQ9R0M3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpxQ9R0M3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms