Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NrkQ9R0G8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NrkQ9R0G8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NrkQ9R0G8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms