Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr54Q9R0D8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms