Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Plod2Q9R0B9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms