Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms