Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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AmfrQ9R049 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmfrQ9R049 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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