Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsjQ9R014 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtsjQ9R014 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms