Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Npas3Q9QZQ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms