Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nr4a3Q9QZB6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms