Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4aQ9QZ15 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4aQ9QZ15 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms