Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Map1aQ9QYR6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Map1aQ9QYR6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Map1aQ9QYR6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms