Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11aQ9QYE3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms