Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx4Q9QY61 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx4Q9QY61 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms