Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxe3Q9QY14 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxe3Q9QY14 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxe3Q9QY14 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxe3Q9QY14 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxe3Q9QY14 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxe3Q9QY14 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxe3Q9QY14 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms