Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jag1Q9QXX0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jag1Q9QXX0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms