Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cln8Q9QUK3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms