Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csnk1eQ9JMK2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csnk1eQ9JMK2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms