Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja4Q9JMC3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja4Q9JMC3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja4Q9JMC3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja4Q9JMC3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja4Q9JMC3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms