Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Reep6Q9JM62 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms