Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cul3Q9JLV5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms