Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Gde1Q9JL56 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gde1Q9JL56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gde1Q9JL56 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gde1Q9JL56 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gde1Q9JL56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gde1Q9JL56 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gde1Q9JL56 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gde1Q9JL56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gde1Q9JL56 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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