Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hip1rQ9JKY5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hip1rQ9JKY5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms