Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb3Q9JKS4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms