Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl39Q9JKF7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms